Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms