Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A3Q01959 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms