Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDR2Q01850 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDR2Q01850 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDR2Q01850 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDR2Q01850 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDR2Q01850 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDR2Q01850 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDR2Q01850 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDR2Q01850 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDR2Q01850 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDR2Q01850 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDR2Q01850 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDR2Q01850 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms