Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA6Q01524 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms