Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAP1Q01518 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAP1Q01518 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms