Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms