Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC5Q00444 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms