Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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