Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL8P80075 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCL8P80075 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL8P80075 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL8P80075 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL8P80075 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL8P80075 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL8P80075 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL8P80075 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL8P80075 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL8P80075 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms