Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM4P67936 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM4P67936 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM4P67936 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM4P67936 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM4P67936 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM4P67936 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM4P67936 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM4P67936 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM4P67936 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms