Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP25P60880 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP25P60880 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms