Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00313P59037 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00313P59037 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms