Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms