Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms