Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RND2P52198 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RND2P52198 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RND2P52198 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RND2P52198 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms