Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA4P51532 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms