Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms