Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TTPAP49638 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTPAP49638 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTPAP49638 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTPAP49638 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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TTPAP49638 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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TTPAP49638 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTPAP49638 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTPAP49638 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTPAP49638 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTPAP49638 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTPAP49638 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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