Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX1P48742 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX1P48742 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX1P48742 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX1P48742 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX1P48742 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX1P48742 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX1P48742 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX1P48742 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX1P48742 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX1P48742 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX1P48742 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX1P48742 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX1P48742 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX1P48742 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX1P48742 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX1P48742 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX1P48742 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms