Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RANGAP1P46060 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms