Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA4P43681 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms