Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTTP42858 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HTTP42858 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTTP42858 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HTTP42858 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTTP42858 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTTP42858 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTTP42858 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTTP42858 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTTP42858 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTTP42858 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTTP42858 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTTP42858 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTTP42858 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTTP42858 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HTTP42858 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HTTP42858 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTTP42858 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTTP42858 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTTP42858 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HTTP42858 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTTP42858 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTTP42858 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTTP42858 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTTP42858 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTTP42858 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HTTP42858 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HTTP42858 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HTTP42858 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTTP42858 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTTP42858 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTTP42858 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTTP42858 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTTP42858 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTTP42858 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTTP42858 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTTP42858 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTTP42858 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTTP42858 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HTTP42858 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTTP42858 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HTTP42858 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTTP42858 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTTP42858 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTTP42858 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTTP42858 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTTP42858 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTTP42858 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTTP42858 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTTP42858 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTTP42858 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTTP42858 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTTP42858 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HTTP42858 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HTTP42858 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTTP42858 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTTP42858 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTTP42858 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTTP42858 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTTP42858 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTTP42858 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTTP42858 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HTTP42858 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTTP42858 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTTP42858 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTTP42858 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTTP42858 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTTP42858 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTTP42858 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTTP42858 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTTP42858 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTTP42858 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HTTP42858 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HTTP42858 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTTP42858 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTTP42858 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTTP42858 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTTP42858 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTTP42858 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTTP42858 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTTP42858 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTTP42858 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTTP42858 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms