Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPOP42166 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPOP42166 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPOP42166 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPOP42166 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPOP42166 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPOP42166 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPOP42166 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPOP42166 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPOP42166 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPOP42166 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPOP42166 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPOP42166 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPOP42166 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPOP42166 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPOP42166 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPOP42166 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPOP42166 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPOP42166 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPOP42166 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPOP42166 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPOP42166 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPOP42166 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPOP42166 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPOP42166 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPOP42166 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPOP42166 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPOP42166 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPOP42166 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPOP42166 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPOP42166 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPOP42166 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPOP42166 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPOP42166 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPOP42166 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPOP42166 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPOP42166 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPOP42166 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPOP42166 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPOP42166 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPOP42166 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPOP42166 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPOP42166 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPOP42166 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPOP42166 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPOP42166 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPOP42166 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMPOP42166 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms