Protein–RNA interactions for Protein: P40157

VID27, Vacuolar import and degradation protein 27, yeastyeast

Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID27P40157 YPL225WYPL225W 441 nt1.05□□□□□ -2.24
VID27P40157 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.04□□□□□ -2.24
VID27P40157 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.04□□□□□ -2.24
VID27P40157 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.04□□□□□ -2.24
VID27P40157 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
VID27P40157 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
VID27P40157 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.04□□□□□ -2.24
VID27P40157 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
VID27P40157 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
VID27P40157 RPL39YJL189W 156 nt1.04□□□□□ -2.24
VID27P40157 CMC4YMR194C-B 222 nt1.04□□□□□ -2.24
VID27P40157 GEA2YEL022W 4380 nt1.04□□□□□ -2.24
VID27P40157 YPR117WYPR117W 7470 nt1.04□□□□□ -2.24
VID27P40157 NHP2YDL208W 471 nt1.03□□□□□ -2.24
VID27P40157 YFL063WYFL063W 456 nt1.03□□□□□ -2.24
VID27P40157 RPL26BYGR034W 384 nt1.03□□□□□ -2.24
VID27P40157 RPS27BYHR021C 249 nt1.03□□□□□ -2.24
VID27P40157 YKL136WYKL136W 399 nt1.03□□□□□ -2.24
VID27P40157 YOR218CYOR218C 420 nt1.03□□□□□ -2.24
VID27P40157 CSE2YNR010W 450 nt1.02□□□□□ -2.25
VID27P40157 UTP20YBL004W 7482 nt1.01□□□□□ -2.25
VID27P40157 QCR9YGR183C 201 nt1.01□□□□□ -2.25
VID27P40157 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.01□□□□□ -2.25
VID27P40157 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1□□□□□ -2.25
VID27P40157 ECM12YHR021W-A 456 nt1□□□□□ -2.25
VID27P40157 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1□□□□□ -2.25
VID27P40157 MCM10YIL150C 1716 nt1□□□□□ -2.25
VID27P40157 YDL073WYDL073W 2955 nt0.99□□□□□ -2.25
VID27P40157 PRP16YKR086W 3216 nt0.99□□□□□ -2.25
VID27P40157 COG8YML071C 1824 nt0.99□□□□□ -2.25
VID27P40157 YFL032WYFL032W 321 nt0.99□□□□□ -2.25
VID27P40157 YIL032CYIL032C 357 nt0.99□□□□□ -2.25
VID27P40157 VIK1YPL253C 1944 nt0.98□□□□□ -2.25
VID27P40157 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.98□□□□□ -2.25
VID27P40157 YDR344CYDR344C 444 nt0.97□□□□□ -2.25
VID27P40157 YDR413CYDR413C 576 nt0.97□□□□□ -2.25
VID27P40157 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.97□□□□□ -2.25
VID27P40157 snR60snR60 104 nt0.96□□□□□ -2.26
VID27P40157 YNL211CYNL211C 261 nt0.96□□□□□ -2.26
VID27P40157 STE5YDR103W 2754 nt0.96□□□□□ -2.26
VID27P40157 BFR2YDR299W 1605 nt0.95□□□□□ -2.26
VID27P40157 SEC8YPR055W 3198 nt0.95□□□□□ -2.26
VID27P40157 YER097WYER097W 330 nt0.94□□□□□ -2.26
VID27P40157 SGF11YPL047W 300 nt0.94□□□□□ -2.26
VID27P40157 YNL028WYNL028W 318 nt0.92□□□□□ -2.26
VID27P40157 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.91□□□□□ -2.26
VID27P40157 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.9□□□□□ -2.27
VID27P40157 NPR2YEL062W 1848 nt0.89□□□□□ -2.27
VID27P40157 SEC1YDR164C 2175 nt0.89□□□□□ -2.27
VID27P40157 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.87□□□□□ -2.27
VID27P40157 YOL014WYOL014W 375 nt0.87□□□□□ -2.27
VID27P40157 BEM3YPL115C 3387 nt0.87□□□□□ -2.27
VID27P40157 ASE1YOR058C 2658 nt0.87□□□□□ -2.27
VID27P40157 YMR160WYMR160W 2451 nt0.87□□□□□ -2.27
VID27P40157 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.86□□□□□ -2.27
VID27P40157 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.85□□□□□ -2.27
VID27P40157 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.85□□□□□ -2.27
VID27P40157 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.84□□□□□ -2.27
VID27P40157 HAL9YOL089C 3093 nt0.84□□□□□ -2.28
VID27P40157 CHS6YJL099W 2241 nt0.84□□□□□ -2.28
VID27P40157 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.83□□□□□ -2.28
VID27P40157 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.83□□□□□ -2.28
VID27P40157 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.83□□□□□ -2.28
VID27P40157 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.83□□□□□ -2.28
VID27P40157 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.83□□□□□ -2.28
VID27P40157 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.83□□□□□ -2.28
VID27P40157 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.83□□□□□ -2.28
VID27P40157 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.83□□□□□ -2.28
VID27P40157 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.83□□□□□ -2.28
VID27P40157 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.83□□□□□ -2.28
VID27P40157 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.83□□□□□ -2.28
VID27P40157 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.83□□□□□ -2.28
VID27P40157 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.83□□□□□ -2.28
VID27P40157 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.83□□□□□ -2.28
VID27P40157 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.82□□□□□ -2.28
VID27P40157 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.82□□□□□ -2.28
VID27P40157 Q0142Q0142 177 nt0.82□□□□□ -2.28
VID27P40157 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.82□□□□□ -2.28
VID27P40157 FYV10YIL097W 1551 nt0.8□□□□□ -2.28
VID27P40157 snR190snR190 190 nt0.8□□□□□ -2.28
VID27P40157 RKR1YMR247C 4689 nt0.8□□□□□ -2.28
VID27P40157 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.79□□□□□ -2.28
VID27P40157 RAD61YDR014W 1944 nt0.79□□□□□ -2.28
VID27P40157 YSP1YHR155W 3687 nt0.79□□□□□ -2.28
VID27P40157 IQG1YPL242C 4488 nt0.79□□□□□ -2.28
VID27P40157 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.78□□□□□ -2.28
VID27P40157 YML002WYML002W 2214 nt0.78□□□□□ -2.28
VID27P40157 MLP1YKR095W 5628 nt0.78□□□□□ -2.29
VID27P40157 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.77□□□□□ -2.29
VID27P40157 COX5BYIL111W 456 nt0.77□□□□□ -2.29
VID27P40157 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.77□□□□□ -2.29
VID27P40157 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.77□□□□□ -2.29
VID27P40157 YNL146WYNL146W 303 nt0.76□□□□□ -2.29
VID27P40157 snR65snR65 100 nt0.75□□□□□ -2.29
VID27P40157 PRP5YBR237W 2550 nt0.75□□□□□ -2.29
VID27P40157 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.74□□□□□ -2.29
VID27P40157 YGR069WYGR069W 336 nt0.73□□□□□ -2.29
VID27P40157 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.73□□□□□ -2.29
VID27P40157 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.73□□□□□ -2.29
VID27P40157 YLR282CYLR282C 342 nt0.73□□□□□ -2.29
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