Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGCXP38435 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGCXP38435 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGCXP38435 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GGCXP38435 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms