Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms