Protein–RNA interactions for Protein: P36873

PPP1CC, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CCP36873 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPP1CCP36873 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPP1CCP36873 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms