Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL4P36578 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL4P36578 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL4P36578 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL4P36578 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL4P36578 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms