Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms