Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN4AP35499 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms