Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.741e-12■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ATAD3A-201ENST00000339113 2330 ntTSL 219.62■□□□□ 0.739e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.739e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.71e-12■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-207ENST00000524464 624 ntTSL 519.4■□□□□ 0.79e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.685e-9■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.639e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.639e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.639e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 LRRC14-203ENST00000527730 978 ntTSL 218.93■□□□□ 0.629e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.599e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 MCCC2-208ENST00000512218 2127 ntTSL 218.58■□□□□ 0.579e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ASMTL-204ENST00000463763 874 ntTSL 218.49■□□□□ 0.559e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.559e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 PLEKHM1-202ENST00000446609 2825 ntTSL 518.46■□□□□ 0.559e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.539e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ZC3H12A-204ENST00000640233 2721 ntTSL 518.3■□□□□ 0.529e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.529e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 WDR26-208ENST00000486652 2867 ntTSL 1 (best)18.25■□□□□ 0.519e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.519e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.51e-12■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.485e-9■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 DAXX-212ENST00000498030 463 ntTSL 218.05■□□□□ 0.489e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CLASRP-202ENST00000391952 2213 ntTSL 1 (best)17.99■□□□□ 0.479e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.479e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.461e-13■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.459e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 TNK2-219ENST00000481865 5940 ntTSL 517.79■□□□□ 0.449e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.421e-12■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 TNK2-211ENST00000438207 870 ntTSL 517.68■□□□□ 0.429e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.66■□□□□ 0.429e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-215ENST00000529306 870 ntTSL 317.56■□□□□ 0.49e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-212ENST00000527485 873 ntTSL 217.56■□□□□ 0.49e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.49e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.49e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 TEAD2-206ENST00000596757 579 ntTSL 517.43■□□□□ 0.389e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 KLC4-212ENST00000470728 872 ntTSL 517.38■□□□□ 0.375e-9■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.379e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.345e-9■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.329e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-214ENST00000529115 855 ntTSL 317■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.39e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.289e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.289e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 LGI4-203ENST00000473160 1102 ntTSL 516.8■□□□□ 0.289e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ATAD3A-205ENST00000429957 498 ntTSL 516.76■□□□□ 0.279e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 C3-213ENST00000600744 708 ntTSL 516.73■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.249e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.249e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-218ENST00000531149 709 ntTSL 316.51■□□□□ 0.239e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.164e-8■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.119e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 DAXX-207ENST00000468536 817 ntTSL 215.74■□□□□ 0.119e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.095e-9■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ARVCF-210ENST00000492625 631 ntTSL 315.58■□□□□ 0.081e-12■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.089e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.089e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 PLEKHM1-207ENST00000581448 3292 ntTSL 1 (best)15.55■□□□□ 0.089e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.064e-8■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.064e-8■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.065e-9■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-209ENST00000525522 3281 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.039e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 NDUFA10-207ENST00000443626 776 ntTSL 515.24■□□□□ 0.039e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.039e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 GRAMD4-205ENST00000447351 375 ntTSL 315.05■□□□□ -09e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-12■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 NUP188-207ENST00000487952 568 ntTSL 214.87□□□□□ -0.039e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ARHGAP35-202ENST00000595822 2977 ntTSL 214.83□□□□□ -0.041e-12■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 PLEKHM1-204ENST00000579197 4995 ntTSL 214.63□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 DAXX-209ENST00000477370 756 ntTSL 314.5□□□□□ -0.099e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.099e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-208ENST00000524780 1059 ntTSL 214.45□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 DAXX-204ENST00000446403 702 ntTSL 314.4□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 AC004840.1-202ENST00000443103 608 ntTSL 514.22□□□□□ -0.139e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.139e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 NDUFA10-212ENST00000485344 4509 ntTSL 214.19□□□□□ -0.149e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 MCCC2-201ENST00000340941 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.189e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 KLC4-215ENST00000479388 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.185e-9■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CLASRP-207ENST00000587112 867 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.189e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 TRIP12-208ENST00000430954 719 ntTSL 213.79□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 NFIA-210ENST00000479364 1010 ntTSL 513.76□□□□□ -0.219e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CSRNP1-202ENST00000514182 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.229e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 HUS1-209ENST00000468868 548 ntTSL 313.38□□□□□ -0.279e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 HUS1-202ENST00000432325 1125 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.279e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 HUS1-207ENST00000446009 579 ntTSL 413.38□□□□□ -0.279e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 513.35□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CLASRP-212ENST00000588936 590 ntTSL 413.21□□□□□ -0.299e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 NUP188-205ENST00000477069 2941 ntTSL 1 (best)13.09□□□□□ -0.319e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 SUGP2-210ENST00000598202 764 ntTSL 413.09□□□□□ -0.314e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-211ENST00000526295 488 ntTSL 312.98□□□□□ -0.339e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.339e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 TLN1-202ENST00000378192 1693 ntTSL 212.93□□□□□ -0.349e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 HUS1-205ENST00000436444 2121 ntTSL 212.92□□□□□ -0.349e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.369e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CLASRP-213ENST00000591410 572 ntTSL 412.48□□□□□ -0.419e-7■■■■■ 27.6
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 220.2 ms