Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP6P35125 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP6P35125 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP6P35125 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP6P35125 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP6P35125 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP6P35125 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP6P35125 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP6P35125 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP6P35125 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP6P35125 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP6P35125 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP6P35125 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP6P35125 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP6P35125 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP6P35125 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP6P35125 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP6P35125 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP6P35125 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP6P35125 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP6P35125 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP6P35125 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP6P35125 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP6P35125 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP6P35125 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP6P35125 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP6P35125 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP6P35125 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP6P35125 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP6P35125 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP6P35125 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP6P35125 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP6P35125 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP6P35125 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP6P35125 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
USP6P35125 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP6P35125 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP6P35125 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP6P35125 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USP6P35125 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP6P35125 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP6P35125 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP6P35125 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP6P35125 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP6P35125 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP6P35125 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP6P35125 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP6P35125 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP6P35125 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP6P35125 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP6P35125 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP6P35125 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP6P35125 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP6P35125 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP6P35125 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP6P35125 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP6P35125 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP6P35125 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP6P35125 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP6P35125 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP6P35125 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP6P35125 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms