Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 WAR1YML076C 2835 nt1.23□□□□□ -2.21
YBL055CP34220 ROM2YLR371W 4071 nt1.22□□□□□ -2.21
YBL055CP34220 snR8snR8 190 nt1.22□□□□□ -2.21
YBL055CP34220 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.22□□□□□ -2.21
YBL055CP34220 SMC1YFL008W 3678 nt1.22□□□□□ -2.21
YBL055CP34220 EAF1YDR359C 2949 nt1.21□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 NST1YNL091W 3723 nt1.2□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.2□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 SGF11YPL047W 300 nt1.2□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 STB6YKL072W 2301 nt1.2□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 snR55snR55 98 nt1.19□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 YDR366CYDR366C 399 nt1.19□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.19□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 CDC39YCR093W 6327 nt1.19□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 RAD9YDR217C 3930 nt1.18□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 OLI1Q0130 231 nt1.18□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 snR74snR74 88 nt1.17□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 YGL041CYGL041C 204 nt1.17□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.17□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 SIP4YJL089W 2490 nt1.16□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 NUP157YER105C 4176 nt1.16□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 IML1YJR138W 4755 nt1.16□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 GEA2YEL022W 4380 nt1.16□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.16□□□□□ -2.22
YBL055CP34220 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.15□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.15□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.15□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 ABF2YMR072W 552 nt1.15□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 YGR130CYGR130C 2451 nt1.15□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 BUD3YCL014W 4911 nt1.13□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 YNL211CYNL211C 261 nt1.13□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 SPT7YBR081C 3999 nt1.13□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.12□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.12□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 CMC4YMR194C-B 222 nt1.12□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 VAM6YDL077C 3150 nt1.12□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 snR80snR80 171 nt1.11□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.11□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 APL1YJR005W 2103 nt1.11□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 NOP9YJL010C 2001 nt1.11□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 PAA1YDR071C 576 nt1.1□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.1□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 TTI1YKL033W 3117 nt1.09□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.09□□□□□ -2.23
YBL055CP34220 NPR2YEL062W 1848 nt1.08□□□□□ -2.24
YBL055CP34220 YKU70YMR284W 1809 nt1.08□□□□□ -2.24
YBL055CP34220 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.08□□□□□ -2.24
YBL055CP34220 YPL044CYPL044C 549 nt1.08□□□□□ -2.24
YBL055CP34220 SCC2YDR180W 4482 nt1.08□□□□□ -2.24
YBL055CP34220 BEM2YER155C 6504 nt1.07□□□□□ -2.24
YBL055CP34220 YDL196WYDL196W 330 nt1.07□□□□□ -2.24
YBL055CP34220 ISD11YER048W-A 285 nt1.07□□□□□ -2.24
YBL055CP34220 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt1.06□□□□□ -2.24
YBL055CP34220 KAP120YPL125W 3099 nt1.05□□□□□ -2.24
YBL055CP34220 DOP1YDR141C 5097 nt1.05□□□□□ -2.24
YBL055CP34220 RPL26BYGR034W 384 nt1.03□□□□□ -2.24
YBL055CP34220 YOR302WYOR302W 78 nt1.03□□□□□ -2.24
YBL055CP34220 YJR029WYJR029W 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.02□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.01□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 ASE1YOR058C 2658 nt1□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 YOR345CYOR345C 351 nt0.99□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 COY1YKL179C 2040 nt0.98□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 BFR2YDR299W 1605 nt0.98□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 ULI1YFR026C 510 nt0.98□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 RPS30BYOR182C 192 nt0.98□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 PMP1YCR024C-A 123 nt0.97□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 SPG3YDR504C 384 nt0.97□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.97□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 COX12YLR038C 252 nt0.97□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 snR190snR190 190 nt0.97□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.97□□□□□ -2.25
YBL055CP34220 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.96□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 YLR282CYLR282C 342 nt0.96□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.95□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 PAU24YBR301W 363 nt0.95□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 BLI1YKL061W 342 nt0.94□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.94□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 SEC8YPR055W 3198 nt0.94□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 YPR117WYPR117W 7470 nt0.94□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 COX5BYIL111W 456 nt0.93□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.93□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 PRP16YKR086W 3216 nt0.92□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.92□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 APQ12YIL040W 417 nt0.92□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 JLP2YMR132C 627 nt0.92□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.91□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 YML002WYML002W 2214 nt0.91□□□□□ -2.26
YBL055CP34220 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.9□□□□□ -2.27
YBL055CP34220 HAL9YOL089C 3093 nt0.9□□□□□ -2.27
YBL055CP34220 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.89□□□□□ -2.27
YBL055CP34220 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.89□□□□□ -2.27
YBL055CP34220 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.89□□□□□ -2.27
YBL055CP34220 YDL073WYDL073W 2955 nt0.89□□□□□ -2.27
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