Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRS3P32247 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRS3P32247 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRS3P32247 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRS3P32247 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRS3P32247 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRS3P32247 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRS3P32247 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRS3P32247 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRS3P32247 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRS3P32247 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRS3P32247 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BRS3P32247 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRS3P32247 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRS3P32247 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRS3P32247 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRS3P32247 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRS3P32247 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms