Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND3P30281 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND3P30281 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND3P30281 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND3P30281 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND3P30281 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND3P30281 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND3P30281 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND3P30281 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND3P30281 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND3P30281 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND3P30281 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND3P30281 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND3P30281 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND3P30281 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND3P30281 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND3P30281 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND3P30281 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCND3P30281 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND3P30281 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND3P30281 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND3P30281 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND3P30281 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND3P30281 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND3P30281 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND3P30281 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND3P30281 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND3P30281 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND3P30281 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND3P30281 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND3P30281 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND3P30281 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND3P30281 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND3P30281 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms