Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms