Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMLP26374 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMLP26374 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMLP26374 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMLP26374 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMLP26374 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMLP26374 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMLP26374 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMLP26374 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMLP26374 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMLP26374 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMLP26374 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMLP26374 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMLP26374 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMLP26374 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMLP26374 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMLP26374 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMLP26374 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMLP26374 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMLP26374 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMLP26374 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMLP26374 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMLP26374 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMLP26374 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMLP26374 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMLP26374 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMLP26374 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMLP26374 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMLP26374 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMLP26374 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMLP26374 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMLP26374 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMLP26374 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMLP26374 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMLP26374 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMLP26374 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMLP26374 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMLP26374 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMLP26374 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMLP26374 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMLP26374 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMLP26374 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMLP26374 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMLP26374 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMLP26374 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMLP26374 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMLP26374 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMLP26374 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMLP26374 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms