Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTX3P26022 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTX3P26022 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTX3P26022 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTX3P26022 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTX3P26022 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTX3P26022 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTX3P26022 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTX3P26022 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms