Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YY1P25490 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YY1P25490 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YY1P25490 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YY1P25490 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YY1P25490 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YY1P25490 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YY1P25490 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YY1P25490 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YY1P25490 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YY1P25490 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YY1P25490 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YY1P25490 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YY1P25490 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YY1P25490 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YY1P25490 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
YY1P25490 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YY1P25490 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YY1P25490 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
YY1P25490 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YY1P25490 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YY1P25490 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YY1P25490 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YY1P25490 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YY1P25490 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YY1P25490 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YY1P25490 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YY1P25490 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
YY1P25490 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YY1P25490 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YY1P25490 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YY1P25490 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
YY1P25490 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YY1P25490 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YY1P25490 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
YY1P25490 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YY1P25490 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YY1P25490 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YY1P25490 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YY1P25490 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
YY1P25490 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
YY1P25490 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YY1P25490 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YY1P25490 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YY1P25490 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YY1P25490 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YY1P25490 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YY1P25490 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YY1P25490 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YY1P25490 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YY1P25490 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YY1P25490 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YY1P25490 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YY1P25490 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YY1P25490 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YY1P25490 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YY1P25490 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YY1P25490 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YY1P25490 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YY1P25490 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YY1P25490 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YY1P25490 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
YY1P25490 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YY1P25490 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YY1P25490 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms