Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCMT1P22061 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCMT1P22061 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms