Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAP43P17677 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAP43P17677 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAP43P17677 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAP43P17677 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAP43P17677 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAP43P17677 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAP43P17677 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAP43P17677 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAP43P17677 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAP43P17677 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAP43P17677 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAP43P17677 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAP43P17677 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAP43P17677 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAP43P17677 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAP43P17677 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAP43P17677 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAP43P17677 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAP43P17677 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAP43P17677 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAP43P17677 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAP43P17677 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAP43P17677 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAP43P17677 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAP43P17677 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GAP43P17677 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAP43P17677 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAP43P17677 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAP43P17677 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAP43P17677 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAP43P17677 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAP43P17677 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms