Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms