Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA4P13612 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms