Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYL1P12980 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYL1P12980 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYL1P12980 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms