Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX6A1P12074 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms