Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RARBP10826 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARBP10826 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARBP10826 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARBP10826 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARBP10826 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARBP10826 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARBP10826 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARBP10826 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RARBP10826 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARBP10826 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARBP10826 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARBP10826 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARBP10826 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARBP10826 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARBP10826 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARBP10826 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARBP10826 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARBP10826 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms