Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3P10147 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCL3P10147 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCL3P10147 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCL3P10147 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCL3P10147 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3P10147 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3P10147 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3P10147 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms