Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALM2P0DP24 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms