Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms