Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM10L2AP0DMW4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms